{"id":30971,"date":"2021-03-16T07:35:06","date_gmt":"2021-03-16T07:35:06","guid":{"rendered":"http:\/\/www.friaguinee.net\/?p=30971"},"modified":"2021-03-16T07:35:07","modified_gmt":"2021-03-16T07:35:07","slug":"guinee-ebola-infecte-il-y-a-cinq-ans-un-survivant-serait-a-lorigine-dune-nouvelle-epidemie","status":"publish","type":"post","link":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/2021\/03\/16\/guinee-ebola-infecte-il-y-a-cinq-ans-un-survivant-serait-a-lorigine-dune-nouvelle-epidemie\/","title":{"rendered":"Guin\u00e9e\/Ebola : Infect\u00e9 il y a cinq ans, un survivant serait \u00e0 l\u2019origine d\u2019une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie"},"content":{"rendered":"\n

Un survivant de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie d\u2019Ebola<\/strong> de grande ampleur ayant s\u00e9vi en Afrique de l\u2019Ouest en 2013-2016 serait \u00e0 l\u2019origine de la flamb\u00e9e \u00e9pid\u00e9mique qui frappe actuellement la Guin\u00e9e. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports ind\u00e9pendants publi\u00e9s le 12 mars 2021 sur le site virological.org.<\/em><\/p>\n\n\n\n

La nouvelle \u00e9pid\u00e9mie d\u2019Ebola en Guin\u00e9e n\u2019aurait donc pas pour origine un nouveau passage du redoutable agent pathog\u00e8ne de l\u2019animal \u00e0 l\u2019homme (anthropozoonose), mais la r\u00e9surgence du virus qui circulait il y a cinq ans \u00e0 partir d\u2019un survivant d\u2019Ebola.<\/p>\n\n\n\n

Changement de paradigme<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Le fait qu\u2019une nouvelle flamb\u00e9e \u00e9pid\u00e9mique puisse se produire \u00e0 partir d\u2019un individu porteur d\u2019une infection latente cinq ans apr\u00e8s une \u00e9pid\u00e9mie ant\u00e9rieure est totalement inattendu*<\/strong>. Cela constitue un changement de paradigme concernant la transmission du virus Ebola dans la mesure o\u00f9 une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie pourrait ne pas forc\u00e9ment \u00e9merger \u00e0 partir d\u2019un franchissement de la barri\u00e8re d\u2019esp\u00e8ce d\u2019un animal sauvage \u00e0 l\u2019homme.<\/p>\n\n\n\n

\u00c0 ce jour, la plus longue dur\u00e9e de persistance du virus chez un survivant de la maladie au virus Ebola \u00e9tait de 531 jours. En 2015, des chercheurs avaient ainsi rapport\u00e9 le cas d\u2019un survivant \u00e2g\u00e9 de 56 ans dont le liquide s\u00e9minal renfermait le virus 17 mois apr\u00e8s l\u2019apparition de la maladie. En f\u00e9vrier 2016, cette personne avait transmis le virus par voie sexuelle 470 jours apr\u00e8s le d\u00e9but des sympt\u00f4mes et avait \u00e9t\u00e9 \u00e0 l\u2019origine d\u2019une flamb\u00e9e \u00e9pid\u00e9mique en Guin\u00e9e et au Liberia.<\/p>\n\n\n\n

Les \u00e9tudes publi\u00e9es sur virological.org<\/em> concernent l\u2019\u00e9pid\u00e9mie de maladie \u00e0 virus Ebola en Guin\u00e9e foresti\u00e8re d\u00e9clar\u00e9e le 14 f\u00e9vrier 2021. \u00c0 ce jour, neuf personnes sont d\u00e9c\u00e9d\u00e9es. C\u2019est la premi\u00e8re fois que la maladie est signal\u00e9e dans ce pays depuis la fin de la dramatique \u00e9pid\u00e9mie ayant s\u00e9vi de 2013 \u00e0 2016. Celle-ci avait \u00e9t\u00e9 responsable de plus de 28 000 cas en Sierra Leone, en Guin\u00e9e et au Liberia, avait entra\u00een\u00e9 plus de 11 000 morts et laiss\u00e9 plus de 10 000 survivants. L\u2019\u00e9pid\u00e9mie avait commenc\u00e9 en Guin\u00e9e, avant de se propager en Sierra Leone et au Liberia.<\/p>\n\n\n\n

Trois \u00e9quipes ont cherch\u00e9 \u00e0 d\u00e9terminer la nature de la souche virale de l\u2019actuelle \u00e9pid\u00e9mie en Guin\u00e9e.<\/p>\n\n\n\n

Concernant la premi\u00e8re \u00e9quipe, trois pr\u00e9l\u00e8vements ont \u00e9t\u00e9 envoy\u00e9s \u00e0 l\u2019Institut Pasteur de Dakar au S\u00e9n\u00e9gal pour s\u00e9quen\u00e7age g\u00e9n\u00e9tique. Les chercheurs, en association avec des biologistes mol\u00e9culaires des universit\u00e9s du Nebraska (\u00c9tats-Unis) et d\u2019\u00c9dimbourg (Royaume-Uni), sont parvenus \u00e0 obtenir deux s\u00e9quences g\u00e9n\u00e9tiques, correspondant respectivement \u00e0 99,6 % et 98,7 % de l\u2019ARN viral g\u00e9nomique.<\/p>\n\n\n\n

Les chercheurs ont compar\u00e9 les deux s\u00e9quences g\u00e9n\u00e9tiques du virus circulant actuellement en Guin\u00e9e \u00e0 1 063 g\u00e9nomes de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie d\u2019Ebola qui avait s\u00e9vi de 2013 \u00e0 2016. Il s\u2019av\u00e8re que les g\u00e9nomes des virus Ebola circulant en 2021 sont extr\u00eamement proches de ceux de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie historique.<\/p>\n\n\n\n

Les g\u00e9nomes partagent par ailleurs dix substitutions qui \u00e9taient apparues lors de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie historique, en particulier une mutation qui \u00e9tait survenue en Sierra Leone et qui t\u00e9moigne d\u2019une adaptation du virus \u00e0 l\u2019homme (mutation A82V dans la glycoprot\u00e9ine). En d\u2019autres termes, le virus circulant actuellement partage certaines caract\u00e9ristiques avec celui qui circulait lors de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie historique. Ces donn\u00e9es montrent que l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle n\u2019a sans doute pas pour origine un nouveau passage \u00e0 l\u2019homme du virus Ebola \u00e0 partir d\u2019un r\u00e9servoir animal, mais qu\u2019elle est directement li\u00e9e aux cas humains survenus en 2013-2016.  <\/p>\n\n\n\n

De fait, les chercheurs pr\u00e9cisent que les g\u00e9nomes du virus circulant cette ann\u00e9e en Guin\u00e9e sont \u00e9troitement apparent\u00e9s \u00e0 la souche Makona qui s\u00e9vissait en ao\u00fbt 2014 dans la m\u00eame r\u00e9gion. Les s\u00e9quences g\u00e9n\u00e9tiques ne divergent que de douze ou treize substitutions en comparaison \u00e0 celles de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie ant\u00e9rieure. Autrement dit, on observe, sur la totalit\u00e9 du g\u00e9nome, une diff\u00e9rence seulement au niveau de douze ou treize lettres entre le virus circulant actuellement et celui qui circulait \u00e0 l\u2019\u00e9poque.<\/p>\n\n\n\n

Il s\u2019agit l\u00e0 d\u2019un taux de mutation tr\u00e8s inf\u00e9rieur \u00e0 celui auquel on s\u2019attendrait si ce virus \u00e0 ARN avait circul\u00e9 durant tout ce temps entre individus, autrement dit s\u2019il avait \u00e9t\u00e9 transmis via plusieurs cha\u00eenes de transmission.<\/p>\n\n\n\n

On estime en effet qu\u2019il se produit 22 ou 23 substitutions par an dans le g\u00e9nome du virus Ebola, ce qui aurait d\u00fb aboutir, en conservant le m\u00eame rythme, \u00e0 plus de 110 mutations cinq ans apr\u00e8s l\u2019\u00e9pid\u00e9mie historique qui s\u2019est achev\u00e9e en 2016. \u00c0 l\u2019inverse, une infection persistante expliquerait que le g\u00e9nome du virus n\u2019\u00e9volue quasiment pas. Il y a donc tout lieu de penser qu\u2019en 2021 l\u2019\u00e9pid\u00e9mie en Guin\u00e9e a d\u00e9but\u00e9 \u00e0 partir d\u2019une personne qui h\u00e9bergeait le virus Ebola depuis au moins cinq ans.<\/p>\n\n\n\n

Cette conclusion est \u00e9galement celle retenue par une autre \u00e9quipe dirig\u00e9e par des chercheurs du centre de recherche et de formation en infectiologie (CERFIG) de l\u2019universit\u00e9 de Conakry (Guin\u00e9e) et leurs coll\u00e8gues fran\u00e7ais de l\u2019universit\u00e9 de Montpellier. Les biologistes mol\u00e9culaires ont compar\u00e9 quatre s\u00e9quences g\u00e9n\u00e9tiques couvrant au moins 99,9 % du g\u00e9nome du virus actuel avec des g\u00e9nomes viraux provenant de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie historique.<\/p>\n\n\n\n

Il ressort que trois g\u00e9nomes du virus circulant actuellement sont strictement identiques et qu\u2019un quatri\u00e8me g\u00e9nome ne diff\u00e8re qu\u2019au niveau d\u2019un seul nucl\u00e9otide (substitution d\u2019une lettre dans le code g\u00e9n\u00e9tique). L\u2019analyse phylog\u00e9n\u00e9tique, visant \u00e0 d\u00e9terminer le degr\u00e9 de parent\u00e9 entre les g\u00e9nomes viraux, a par ailleurs montr\u00e9 que les s\u00e9quences de 2021 appartiennent \u00e0 un groupe de virus qui circulait lors de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie historique qui a s\u00e9vi entre 2013 et 2016. Les chercheurs en concluent donc que la nouvelle \u00e9pid\u00e9mie est le r\u00e9sultat de la r\u00e9surgence d\u2019une souche qui circulait en Afrique de l\u2019Ouest en 2013-2016 et que le faible taux de mutation observ\u00e9 lors de la comparaison des s\u00e9quences g\u00e9n\u00e9tiques serait d\u00fb \u00e0 la persistance du virus Ebola, maintenu dans un \u00e9tat de latence, chez un survivant.<\/p>\n\n\n\n

Le troisi\u00e8me rapport, \u00e9manant de chercheurs du laboratoire Projet des fi\u00e8vres h\u00e9morragiques de Guin\u00e9e (PFHG) de Conakry en association avec leurs homologues de l\u2019Institut de m\u00e9decine tropicale de Hambourg (Allemagne),  rapporte des r\u00e9sultats similaires.<\/p>\n\n\n\n

En Guin\u00e9e, le cas index est une infirmi\u00e8re de 51 ans<\/strong><\/p>\n\n\n\n

L\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle en Guin\u00e9e est apparue entre le 18 janvier et le 13 f\u00e9vrier 2021 dans la sous-pr\u00e9fecture de Gou\u00e9ck\u00e9, dans la r\u00e9gion de Nz\u00e9r\u00e9kor\u00e9. Les patients pr\u00e9sentaient de la diarrh\u00e9e, des vomissements et des saignements apr\u00e8s avoir assist\u00e9 \u00e0 l\u2019enterrement d\u2019un membre de leur famille, le 1er f\u00e9vrier 2021. Le cas index \u00e9tait une infirmi\u00e8re de 51 ans qui avait consult\u00e9 le 18 janvier 2021 dans un centre de sant\u00e9 pour des maux de t\u00eate, des naus\u00e9es et vomissements, une perte d\u2019app\u00e9tit, des douleurs abdominales, de la fi\u00e8vre et de la fatigue.<\/p>\n\n\n\n

Un diagnostic de fi\u00e8vre typho\u00efde avait alors \u00e9t\u00e9 pos\u00e9. Le 23 janvier 2021, elle a demand\u00e9 un deuxi\u00e8me avis m\u00e9dical dans un autre \u00e9tablissement de sant\u00e9 o\u00f9 un diagnostic de paludisme avait \u00e9t\u00e9 pos\u00e9. Elle est d\u00e9c\u00e9d\u00e9e cinq jours plus tard apr\u00e8s avoir entre temps consult\u00e9 un praticien traditionnel. Le 1er f\u00e9vrier, les mesures recommand\u00e9es pour une inhumation sans danger n\u2019ont pas \u00e9t\u00e9 appliqu\u00e9es. Les cinq membres de sa famille et le praticien traditionnel qu\u2019elle a consult\u00e9 ont \u00e9t\u00e9 contamin\u00e9s. Sur ces sept cas group\u00e9s, cinq sont d\u00e9c\u00e9d\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n

On sait que le virus Ebola peut \u00e9chapper au syst\u00e8me immunitaire, en r\u00e9sidant dans le globe oculaire, les testicules ou le liquide c\u00e9phalo-rachidien, qui repr\u00e9sentent ce que les sp\u00e9cialistes appellent des sanctuaires immunologiques. Dans de rares cas, un survivant de la maladie \u00e0 virus Ebola peut faire une rechute lorsque le virus se r\u00e9active. Cela a \u00e9t\u00e9 le cas de l\u2019infirmi\u00e8re britannique Pauline Cafferkey qui, apr\u00e8s avoir \u00e9t\u00e9 infect\u00e9e en Sierra Leone, avait d\u00e9velopp\u00e9 l\u2019ann\u00e9e suivante une m\u00e9ningo-enc\u00e9phalite lors d\u2019une r\u00e9activation du virus. Elle avait due \u00eatre hospitalis\u00e9e quelques mois plus tard car pr\u00e9sentant des sympt\u00f4mes apr\u00e8s une seconde r\u00e9activation.<\/p>\n\n\n\n

Comment expliquer chez un survivant la r\u00e9activation du virus Ebola apr\u00e8s plusieurs ann\u00e9es ? L\u2019hypoth\u00e8se de loin la plus probable est que le virus, maintenu \u00e0 l\u2019\u00e9tat latent dans les testicules, soit r\u00e9activ\u00e9 \u00e0 la faveur d\u2019une infection intercurrente ou d\u2019une baisse de l\u2019immunit\u00e9 et ait \u00e9t\u00e9 ensuite transmis lors d\u2019un rapport sexuel. L\u2019infirmi\u00e8re guin\u00e9enne a donc sans doute \u00e9t\u00e9 contamin\u00e9e par voie sexuelle par un individu contamin\u00e9 par Ebola il y a cinq ans et qui a r\u00e9cemment fait une rechute. On ne peut cependant exclure que l\u2019infirmi\u00e8re ait \u00e9t\u00e9 infect\u00e9e par le virus plusieurs ann\u00e9es auparavant et n\u2019ait d\u00e9velopp\u00e9 que peu de sympt\u00f4mes. Dans ce cas, elle pourrait elle-m\u00eame avoir \u00e9t\u00e9 une survivante d\u2019Ebola, sans m\u00eame le savoir, et avoir fait une rechute.<\/p>\n\n\n\n

\u00c9viter la stigmatisation des survivants d\u2019Ebola<\/strong><\/p>\n\n\n\n

\u00ab Sur un plan pratique, le fait qu\u2019un patient survivant d\u2019Ebola puisse, \u00e0 l\u2019occasion d\u2019une rechute, \u00eatre \u00e0 l\u2019origine d\u2019une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie montre la n\u00e9cessit\u00e9 de d\u00e9velopper la recherche de m\u00e9dicaments antiviraux, seul moyen pour \u00e9radiquer un virus qui demeure \u00e0 l\u2019\u00e9tat latent dans l\u2019organisme \u00bb,<\/em> souligne Eric Delaporte, professeur de maladies infectieuses \u00e0 l\u2019universit\u00e9 de Montpellier (unit\u00e9 IRD\/Inserm) et co-auteur de la premi\u00e8re \u00e9tude. Et ce sp\u00e9cialiste d\u2019ajouter que \u00ab du fait de la fr\u00e9quence des \u00e9pid\u00e9mies d\u2019Ebola, survenant parfois dans des zones urbaines dens\u00e9ment peupl\u00e9es, le nombre des survivants est plus important, ce qui augmente le risque de r\u00e9activation du virus \u00bb.<\/em><\/p>\n\n\n\n

\u00ab L\u2019information d\u2019une r\u00e9surgence d\u2019Ebola \u00e0 partir d\u2019un survivant est \u00e0 manier avec beaucoup de pr\u00e9caution compte tenu de la stigmatisation que subissent ces personnes. En effet, notre \u00e9quipe ayant r\u00e9cemment rapport\u00e9 que ces patients survivants peuvent encore pr\u00e9senter des s\u00e9quelles quatre ans apr\u00e8s avoir \u00e9t\u00e9 d\u00e9clar\u00e9s gu\u00e9ris, il ne s\u2019agit donc pas que cette population d\u00e9j\u00e0 vuln\u00e9rable soit \u00e0 nouveau stigmatis\u00e9e \u00bb,<\/em> d\u00e9clare Eric Delaporte. \u00ab La pr\u00e9valence des sympt\u00f4mes sur ces survivants d\u2019Ebola diminue au fil des ann\u00e9es, mais reste \u00e9tonnamment \u00e9lev\u00e9e, traduisant l\u2019existence de formes que l\u2019on pourrait appeler \u00ab Ebola long \u00bb, voire tr\u00e8s long, par analogie avec la d\u00e9nomination utilis\u00e9e dans la Covid-19 \u00bb,<\/em> conclut-il.<\/p>\n\n\n\n

Marc Gozlan<\/strong>\u00a0\u00a0<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Un survivant de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie d\u2019Ebola de grande ampleur ayant s\u00e9vi en Afrique de l\u2019Ouest en 2013-2016 serait \u00e0 l\u2019origine de la flamb\u00e9e \u00e9pid\u00e9mique qui frappe actuellement la Guin\u00e9e. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports ind\u00e9pendants publi\u00e9s le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle \u00e9pid\u00e9mie d\u2019Ebola en Guin\u00e9e n\u2019aurait donc pas pour origine […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":30972,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[4],"tags":[1488,6171,6179,148,6388,6387],"class_list":["post-30971","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-sante","tag-5-ans","tag-ebola","tag-epidemie","tag-guinee","tag-infecte","tag-survivant"],"_links":{"self":[{"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30971","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=30971"}],"version-history":[{"count":1,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30971\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":30973,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30971\/revisions\/30973"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media\/30972"}],"wp:attachment":[{"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=30971"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=30971"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"http:\/\/www.friaguinee.net\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=30971"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}